Selon l’OMS, le nouveau variant mutant « XE » Omicron pourrait être la version la plus transmissible de Covid à ce jour
L’UKHSA publie une analyse actualisée des variantes recombinantes du COVID-19 au Royaume-Uni
Le plus récent briefing technique de l’UKHSA sur les variants comprend l’examen d’un certain nombre de variants recombinants qui ont été identifiés au Royaume-Uni, ainsi qu’une analyse épidémiologique et génomique actualisée de l’Omicron BA.2.
Une variante recombinante se produit lorsqu’un individu est infecté par deux ou plusieurs variantes en même temps, ce qui entraîne un mélange de leur matériel génétique dans l’organisme du patient. Ce phénomène n’est pas inhabituel et plusieurs variantes recombinantes du SRAS-CoV-2 ont été identifiées au cours de la pandémie.
Comme pour toute autre variante du coronavirus (COVID-19), la grande majorité ne confère aucun avantage au virus et s’éteint relativement rapidement.
La nouvelle analyse de l’UKHSA examine 3 recombinants, appelés XF, XE et XD. Parmi ceux-ci, XD et XF sont des recombinants de Delta et Omicron BA.1, tandis que XE est un recombinant de Omicron BA.1 et BA.2.
Au Royaume-Uni, 38 cas de FX ont été identifiés, mais aucun n’a été observé depuis la mi-février. Il n’y a actuellement aucune preuve de transmission communautaire au Royaume-Uni.
Le XD n’a pas été identifié au Royaume-Uni à ce jour, bien que 49 cas aient été signalés aux bases de données mondiales, la majorité d’entre eux en France.
Au total, 637 cas de XE – un recombinant d’Omicron BA.1 et BA.2 – ont été confirmés au Royaume-Uni jusqu’à présent. Le plus ancien d’entre eux a une date de prélèvement du 19 janvier 2022. Les preuves sont actuellement insuffisantes pour tirer des conclusions sur l’avantage de croissance ou d’autres propriétés de cette variante. Nous continuons à surveiller de près tous les recombinants, grâce à notre capacité de surveillance et de séquençage génomique de pointe.
Le professeur Susan Hopkins, conseillère médicale en chef de l’UKHSA, a déclaré :
Les variants recombinants ne sont pas un phénomène inhabituel, en particulier lorsqu’il y a plusieurs variants en circulation, et plusieurs ont été identifiés au cours de la pandémie jusqu’à présent. Comme pour les autres types de variants, la plupart disparaîtront relativement vite.
Ce recombinant particulier, XE, a montré un taux de croissance variable et nous ne pouvons pas encore confirmer s’il a un véritable avantage de croissance. Jusqu’à présent, il n’y a pas assez de preuves pour tirer des conclusions sur la transmissibilité, la sévérité ou l’efficacité du vaccin.
L’UKHSA continuera à suivre de près la situation, comme elle le fait pour toutes les données relatives aux variantes du SRAS-CoV-2 au Royaume-Uni et dans le monde.
Le briefing technique sur les variantes comprend également une analyse actualisée de l’Omicron BA.2, qui est actuellement la variante dominante au Royaume-Uni.
On estime que le BA.2 représente environ 93,7% des cas en Angleterre, la prévalence la plus élevée se situant dans le Sud-Est (96,4%) et la plus faible dans les East Midlands (91,1%). Les données pour l’Ecosse, le Pays de Galles et l’Irlande du Nord ne sont pas incluses dans le Briefing technique de l’UKHSA.
La BA.2 continue de démontrer un avantage de croissance substantiel. Depuis la mi-février, ce taux de croissance s’est établi à environ 75% de plus que les autres lignées Omicron en circulation en Angleterre.
L’analyse en cours de l’UKHSA n’a trouvé aucune preuve que l’infection par Omicron BA.2 entraîne un plus grand risque d’hospitalisation, par rapport à Omicron BA.1.
L’UKHSA a également publié cette semaine de nouvelles données sur l’efficacité du vaccin contre l’hospitalisation après une dose de rappel. Pour la première fois, ces données comprennent une analyse de l’efficacité du vaccin 15+ semaines après la dose de rappel.
Ces données montrent que la protection contre la maladie grave due au COVID-19 reste supérieure à 90 % chez les personnes âgées de 65 ans et plus jusqu’à 14 semaines après une dose de rappel. Bien qu’il soit suggéré que cette protection diminue légèrement après 15 semaines, la protection dans ce groupe d’âge reste élevée, à plus de 85 %.
Modification de la classification des variantes
L’UKHSA est en train de mettre à jour son système de classification des variantes afin de donner une indication plus claire des variantes qui présentent des changements importants par rapport à la variante dominante actuelle.
Dans le cadre du nouveau système, le label « variant préoccupant » (VOC) sera attribué aux variants qui sont actuellement émergents ou en circulation, et dont les caractéristiques suivantes peuvent être confirmées ou prédites :
- Une modification préjudiciable des propriétés biologiques (modification de la transmissibilité, de la gravité ou de l’évasion immunitaire) par rapport à la variante dominante actuelle.
- Un taux de croissance potentiellement compatible avec le remplacement éventuel de la variante dominante actuelle.
Il n’y aura aucune autre catégorisation des variantes, y compris aucune catégorie de variante en cours d’investigation (VUI). Les anciennes variantes préoccupantes qui ne répondent plus aux critères seront redésignées.
L’UKHSA continuera à désigner de nouvelles variantes, qui recevront un numéro de variante (sous la forme V-date-numéro). Nous continuerons à analyser de près toutes les preuves biologiques, épidémiologiques et génomiques disponibles pour toute variante du SRAS-CoV-2 au Royaume-Uni ou à l’étranger.
Ces changements prendront effet à partir du 1er avril 2022 et seront reflétés dans leur intégralité dans les prochains briefings techniques.
mis à jour le 30 janvier 2022
La variante Omicron hautement transmissible du virus SRAS-CoV-2 – dont la forme la plus courante est connue sous le nom de BA.1 – représente aujourd’hui la quasi-totalité des infections à coronavirus dans le monde, bien que des poussées spectaculaires de cas de COVID aient déjà atteint un pic dans certains pays.
Les scientifiques suivent maintenant une augmentation des cas causés par un proche cousin, le BA.2, qui commence à supplanter le BA.1 dans certaines régions d’Europe et d’Asie. Voici ce que nous savons à ce jour sur ce nouveau sous-variant :
LE SOUS-VARIANT « FURTIF ».
À l’échelle mondiale, le BA.1 représentait 98,8 % des cas séquencés soumis à la base de données publique de suivi des virus GISAID au 25 janvier. Mais plusieurs pays signalent une augmentation récente de la sous-variante BA.2, selon l’Organisation mondiale de la santé.
En plus de BA.1 et BA.2, l’OMS énumère deux autres sous-variantes sous l’égide d’Omicron : BA.1.1.529 et BA.3. Tous sont étroitement liés génétiquement, mais chacun présente des mutations qui pourraient modifier son comportement.
Trevor Bedford, virologue informaticien au Fred Hutchinson Cancer Center, qui a suivi l’évolution du SRAS-CoV-2, a écrit vendredi sur Twitter que le BA.2 représente environ 82 % des cas au Danemark, 9 % au Royaume-Uni et 8 % aux États-Unis, d’après son analyse des données de séquençage de la base de données GISAID et du nombre de cas du projet Our World in Data de l’université d’Oxford.
La version BA.1 d’Omicron a été un peu plus facile à suivre que les variantes précédentes. En effet, il manque à la version BA.1 l’un des trois gènes cibles utilisés dans un test PCR courant. Les cas présentant ce modèle ont été considérés par défaut comme étant causés par BA.1.
Le BA.2, parfois appelé sous-variant « furtif », ne présente pas le même gène cible manquant. Au lieu de cela, les scientifiques le surveillent de la même manière qu’ils ont surveillé les variantes précédentes, y compris Delta, en suivant le nombre de génomes de virus soumis aux bases de données publiques telles que GISAID.
Comme pour les autres variantes, une infection par le BA.2 peut être détectée par des kits de tests à domicile pour les coronavirus, bien qu’ils ne puissent pas indiquer quelle variante est responsable, selon les experts.
PLUS TRANSMISSIBLE ?
Certains rapports préliminaires indiquent que le BA.2 pourrait être encore plus infectieux que le BA.1, déjà extrêmement contagieux, mais rien ne prouve jusqu’à présent qu’il soit plus susceptible d’échapper à la protection vaccinale.
Les autorités sanitaires danoises estiment que le BA.2 pourrait être 1,5 fois plus transmissible que le BA.1, sur la base de données préliminaires, bien qu’il n’entraîne probablement pas de maladie plus grave. en savoir plus
En Angleterre, une analyse préliminaire de la recherche des contacts entre le 27 décembre 2021 et le 11 janvier 2022 par l’Agence de sécurité sanitaire britannique (HSA) suggère que la transmission à domicile est plus élevée chez les contacts des personnes infectées par le BA.2 (13,4 %) que chez les autres cas Omicron (10,3 %).
La HSA n’a trouvé aucune preuve d’une différence dans l’efficacité du vaccin, selon le rapport du 28 janvier.
Une question essentielle est de savoir si les personnes qui ont été infectées lors de la vague BA.1 seront protégées de la BA.2, a déclaré le Dr Egon Ozer, expert en maladies infectieuses à la Northwestern University Feinberg School of Medicine à Chicago.
Cela a été une préoccupation au Danemark, où certaines régions qui ont connu un nombre élevé de cas d’infections par le BA.1 ont signalé une augmentation des cas de BA.2, a déclaré le Dr Ozer.
Si une infection antérieure par le BA.1 ne protège pas contre le BA.2, « cela pourrait être une sorte de vague à deux bosses », a déclaré Ozer. « Il est trop tôt pour savoir si cela se produira ».
La bonne nouvelle, a-t-il ajouté, c’est que les vaccins et les rappels permettent toujours « d’éviter que les gens ne soient hospitalisés et qu’ils ne meurent. »
nouvelle mise à jour le 23/12/2021
Le Dr Angelique Coetzee, le médecin qui a été le premier à détecter la variante Omicron en Afrique du Sud, a répondu à 10 questions courantes que vous pourriez vous poser avant le jour de Noël.
Veuillez noter que ces 10 questions ne représentent que les points de vue et opinions personnels du Dr Angelique Coetzee, et non la position de notre site web, notamment en ce qui concerne les verrouillages, nous vous suggérons de suivre les règles établies par les gouvernements.
1. Si une personne est infectée dans une famille, les autres sont-elles en sécurité ?
Le taux de transmission d’Omicron dans les ménages est élevé, a déclaré le Dr Angelique Coetzee. Le Dr Coetzee a ajouté : « Si une personne dans une famille de sept personnes l’a, soyez assurés que les six autres l’auront aussi. »
2. Les patients atteints d’infections légères doivent-ils être hospitalisés ?
Les patients présentant des symptômes légers ont également besoin d’un traitement, même s’ils n’ont pas besoin d’être hospitalisés.
« Les admissions à l’hôpital [en Afrique du Sud] sont stables et doublent tous les deux jours. Le virus se propage rapidement », a déclaré le Dr Coetzee. Elle a ajouté qu’une majorité des patients Covid dans les unités de soins intensifs (USI) ne sont pas vaccinés, tandis que ceux qui ont reçu le vaccin présentent des symptômes légers.
3. Omicron menace-t-il certains plus que d’autres ?
Affirmant qu’il ne faut pas sous-estimer une infection virale, le Dr Coetzee a déclaré : « Si vous êtes en surpoids et non vacciné, alors Omicron vous troublera. »
4. Quels sont les symptômes courants d’Omicron ?
« Omicron commence par des douleurs musculaires. Ce n’est pas de la toux et de la fièvre », explique le médecin qui a été le premier à détecter la variante.
Selon le Dr Angelique Coetzee, « les douleurs du bas du dos font partie des nouveaux symptômes. Le tableau clinique est davantage une douleur musculaire qu’un nez bouché et une toux. »
Les autres symptômes comprennent un corps endolori, de la fatigue et un mal de tête.
5. Dans combien de temps pourra-t-on sortir à nouveau en toute sécurité ?
Le Dr Coetzee affirme que si les vaccins nous protègent, « la fermeture des marchés ne fonctionnera pas. Nous devons vivre avec le virus. Lorsque les hôpitaux verront plus de patients, c’est à ce moment-là que nous devrons intervenir à nouveau. »
6. Y a-t-il un lien entre Covid et la pneumonie ?
« Il [la variante Omicron] s’attaque aux voies respiratoires supérieures. Vous pouvez aussi contracter une pneumonie, bien que la plupart des cas soient bénins », a déclaré le Dr Angelique Coetzee.
7. Dois-je recevoir une dose de rappel ?
Le Dr Coetzee conseille aux gens de recevoir une dose de rappel du vaccin Covid-19.
8. Les mesures de confinement fonctionnent-elles ?
« Nous nous attendons à ce que les cas augmentent après la saison des fêtes… Les mesures de confinement ne fonctionneront pas. Le virus est partout. Vous devez atténuer les risques. Utilisez votre bon sens. La fermeture des marchés, etc. ne fonctionnera pas. Nous devons vivre avec le virus », a déclaré le Dr Angelique Coetzee.
9. Quand faut-il renforcer les restrictions ?
Le Dr Coetzee a ajouté que nous devons « intervenir à nouveau » lorsque les hôpitaux voient plus de patients.
10. Peut-on faire la fête le jour de l’an en toute sécurité ?
« Les cas [d’Omicron] sont bénins mais les choses pourraient changer », a déclaré le Dr Angelique Coetzee.
« Les taux de séropositivité sont élevés en Afrique du Sud. L’Inde pourrait également connaître une poussée en suivant une trajectoire similaire. Il y a des épidémies groupées [en Afrique du Sud] – la même expérience qu’en Inde », a déclaré le Dr Coetzee aux médias.
nouvelle mise à jour le 20 décembre 2021
Quelle est la gravité des infections Omicron ?
Moins de quatre semaines se sont écoulées depuis l’annonce de la découverte d’une variante du coronavirus chargée de mutations en Afrique australe. Depuis lors, des dizaines de pays dans le monde ont signalé des cas d’Omicron, dont un nombre inquiétant d’infections chez des personnes qui avaient été vaccinées ou avaient déjà été infectées par le SRAS-CoV-2.
Mais si les dirigeants politiques et les responsables de la santé publique tentent de tracer la voie à suivre pour faire face aux prochaines poussées d’Omicron, ils doivent le faire sans avoir de réponse ferme à une question clé : quelle sera la gravité de ces infections Omicron ?
Jusqu’à présent, les données sont rares et incomplètes. « Il y a inévitablement un décalage entre l’infection et l’hospitalisation », explique Mark Woolhouse, épidémiologiste spécialiste des maladies infectieuses à l’université d’Édimbourg, au Royaume-Uni. « Dans l’intervalle, des décisions politiques doivent être prises et ce n’est pas simple ».
Taux d’hospitalisation
Les premiers résultats laissent entrevoir une lueur d’espoir. Des rapports en provenance d’Afrique du Sud ont régulièrement fait état d’un taux d’hospitalisation plus faible à la suite d’infections par le virus Omicron par rapport aux infections causées par la variante Delta, qui est actuellement responsable de la plupart des infections par le SRAS-CoV-2 dans le monde. Le 14 décembre, l’assureur santé privé sud-africain Discovery Health de Johannesburg a annoncé que le risque d’hospitalisation était inférieur de 29 % chez les personnes infectées par Omicron, par rapport aux personnes infectées par une variante antérieure.
Cela a alimenté les suggestions selon lesquelles Omicron provoque une maladie plus bénigne que les variantes précédentes. Mais les chercheurs affirment qu’il est trop tôt pour en être sûr, et les principaux détails méthodologiques de cette étude n’ont pas encore été publiés. Ces détails sont cruciaux pour l’interprétation des données sur la gravité de la maladie, qui peuvent être faussées par des facteurs tels que la capacité des hôpitaux, l’âge et l’état de santé général des personnes initialement infectées, et l’ampleur de l’exposition antérieure au coronavirus.
Mais les résultats de Discovery Health sont conformes à ceux d’autres études menées dans le pays, déclare Waasila Jassat, clinicienne et spécialiste de la santé publique à l’Institut national des maladies transmissibles de Johannesburg. « Il y a beaucoup de mises en garde et d’avertissements autour des données sur la gravité précoce », dit-elle. « Mais le tableau est très cohérent ».
Il faudra du temps pour qu’une image cohérente se dégage des pays qui comptent actuellement moins d’infections par Omicron. Le 13 décembre, le Danemark a publié des données montrant que les taux d’hospitalisation des personnes infectées par Omicron semblaient être comparables à ceux des personnes infectées par d’autres variantes. Mais cette comparaison n’était basée que sur environ 3 400 cas d’infection par Omicron et 37 hospitalisations.
De même, un rapport publié le 16 décembre par l’Imperial College de Londres n’a trouvé aucune preuve d’une diminution du nombre d’hospitalisations dues aux infections par Omicron par rapport à Delta en Angleterre, bien que ce rapport soit également basé sur un nombre relativement faible de cas. Dans l’ensemble, les chiffres sont encore trop faibles pour tirer des conclusions définitives sur la gravité de la maladie causée par Omicron, déclare Troels Lillebæk, spécialiste des maladies infectieuses à l’université de Copenhague.
Et une variante qui se propage rapidement pourrait mettre dangereusement à l’épreuve les systèmes de soins de santé, même si le risque de maladie grave ou de décès est relativement faible pour chaque individu. « Une petite fraction d’un très grand nombre reste un grand nombre », déclare Woolhouse. « La menace au niveau de la population est donc bien réelle ».
Les données optimistes de l’Afrique du Sud ne sont peut-être pas le signe qu’Omicron lui-même est plus bénin que les variantes précédentes. Selon M. Jassat, plus de 70 % de la population des régions fortement infectées par Omicron ont déjà été exposés au SRAS-CoV-2, et environ 40 % ont reçu au moins une dose du vaccin COVID-19. Il est donc difficile de dissocier les effets de l’immunité préexistante des propriétés inhérentes à la variante elle-même.
Protection vaccinale
Des études en laboratoire ont suggéré qu’Omicron pourrait être capable d’échapper à une partie de l’immunité induite par le vaccin COVID, et les premières données de l’Agence britannique de sécurité sanitaire suggèrent que les vaccins ne sont pas aussi protecteurs contre les infections à Omicron qu’ils l’ont été contre d’autres variantes, bien que le nombre de cas étudiés soit trop faible pour être sûr de l’ampleur de la diminution de la protection.
Malgré cela, les vaccins pourraient continuer à protéger de nombreux receveurs de maladies graves et de décès dus au COVID-19. Outre les anticorps, le système immunitaire des personnes précédemment infectées et vaccinées déploie des cellules appelées lymphocytes T qui peuvent reconnaître des fragments de protéines virales et détruire les cellules infectées par le virus, limitant ainsi potentiellement la portée d’une infection.
Les chercheurs ont cartographié la panoplie de mutations d’Omicron sur le menu des fragments protéiques du SRAS-CoV-2 reconnus par les cellules T à la suite d’une infection naturelle et d’une vaccination, et n’ont trouvé aucune mutation dans la plupart de ces fragments. Dans le cas de la vaccination, plus de 70 % des fragments sont totalement intacts, selon l’immunologiste Alessandro Sette de l’Institut d’immunologie de La Jolla en Californie.
Il reste encore du travail à faire – les scientifiques effectuent déjà des essais en laboratoire pour déterminer dans quelle mesure les cellules T générées en réponse à des vaccins et à une infection par d’autres variants réagissent à Omicron, les résultats étant attendus dans les semaines à venir. « Je suis optimiste quant au fait que la réactivité va être préservée, du moins en partie », déclare Sette. « Reste à savoir dans quelle mesure elle sera préservée ».
Pour l’instant, il n’y a aucun moyen de tracer une ligne directe entre le degré de réactivité des cellules T et la protection contre la maladie grave. Des études antérieures ont montré que des réactions robustes des cellules T au SRAS-CoV-2 sont corrélées à des charges virales plus faibles et à une maladie moins grave, mais elles n’établissent pas de seuil à partir duquel cette protection pourrait commencer à s’estomper, explique M. Sette. En définitive, il s’agira encore d’attendre les données sur les hospitalisations et les décès liés à Omicron.
Infections chez les enfants
Au fur et à mesure que ces données émergeront, les chercheurs s’intéresseront particulièrement aux effets d’Omicron sur les enfants. Des résultats provenant d’Afrique du Sud suggèrent que les taux d’hospitalisation des enfants infectés par Omicron sont plus élevés que ceux observés lors des vagues précédentes. Mais les chercheurs rappellent que cela ne signifie pas nécessairement que les enfants sont plus vulnérables à Omicron qu’ils ne l’étaient à Delta ou à d’autres variantes. M. Jassat note que les enfants présentent des taux d’infection et de vaccination antérieurs par des coronavirus plus faibles que les adultes, ce qui signifie que leurs niveaux d’immunité préexistante ne sont pas aussi élevés.
Les taux plus élevés d’hospitalisation d’enfants au cours des premiers stades d’une épidémie pourraient également refléter une plus grande capacité hospitalière, ce qui permet de garder en observation un enfant qui, autrement, serait renvoyé chez lui, ajoute-t-elle.
Le cadre dans lequel les enfants sont exposés peut également jouer un rôle : une exposition prolongée à la maison par un parent infecté peut signifier une exposition initiale au virus plus élevée qu’une exposition passagère à l’école, explique David Dowdy, épidémiologiste spécialisé dans les maladies infectieuses à l’école de santé publique Johns Hopkins Bloomberg de Baltimore (Maryland). « Tout le monde se concentre sur l’agent pathogène ici », dit-il. « Mais il ne s’agit pas seulement de la variante, il y a aussi l’hôte et l’environnement ».
doi: https://doi.org/10.1038/d41586-021-03794-8
Mise à jour de l’OMS sur Omicron – 28 novembre 2021
Le 26 novembre 2021, l’OMS a désigné la variante B.1.1.529 comme une variante préoccupante, appelée Omicron, sur les conseils du Groupe consultatif technique sur l’évolution des virus (TAG-VE) de l’OMS. Cette décision s’appuie sur les preuves présentées au TAG-VE selon lesquelles Omicron présente plusieurs mutations qui peuvent avoir un impact sur son comportement, par exemple sur sa facilité de propagation ou la gravité de la maladie qu’il provoque. Voici un résumé de ce que l’on sait actuellement.
Connaissances actuelles sur Omicron
Des chercheurs d’Afrique du Sud et du monde entier mènent des études pour mieux comprendre de nombreux aspects d’Omicron. Nous continuerons à partager les résultats de ces études dès qu’ils seront disponibles.
Transmissibilité : On ne sait pas encore si Omicron est plus transmissible (c’est-à-dire plus facilement transmissible d’une personne à l’autre) que d’autres variantes, notamment Delta. Le nombre de personnes testées positives a augmenté dans les régions d’Afrique du Sud touchées par cette variante, mais des études épidémiologiques sont en cours pour comprendre si cela est dû à Omicron ou à d’autres facteurs.
Gravité de la maladie : On ne sait pas encore si l’infection par Omicron entraîne une maladie plus grave que les infections par d’autres variantes, notamment Delta. Les données préliminaires suggèrent une augmentation des taux d’hospitalisation en Afrique du Sud, mais cela pourrait être dû à l’augmentation du nombre total de personnes infectées, plutôt qu’à une infection spécifique par Omicron. Aucune information ne permet actuellement de penser que les symptômes associés à Omicron sont différents de ceux des autres variantes. Les premières infections signalées concernaient des étudiants universitaires – des personnes plus jeunes qui ont tendance à présenter une maladie plus bénigne – mais il faudra plusieurs jours à plusieurs semaines pour comprendre le niveau de gravité de la variante Omicron. Toutes les variantes de COVID-19, y compris la variante Delta qui est dominante dans le monde, peuvent provoquer une maladie grave ou la mort, en particulier chez les personnes les plus vulnérables, et la prévention est donc toujours essentielle.
Efficacité d’une infection antérieure par le SRAS-CoV-2
Les données préliminaires suggèrent qu’il pourrait y avoir un risque accru de réinfection avec l’Omicron (c’est-à-dire que les personnes ayant déjà eu le COVID-19 pourraient être réinfectées plus facilement avec l’Omicron), par rapport aux autres variantes préoccupantes, mais les informations sont limitées. De plus amples informations à ce sujet seront disponibles dans les jours et semaines à venir.
Efficacité des vaccins : L’OMS travaille avec des partenaires techniques pour comprendre l’impact potentiel de ce variant sur nos contre-mesures existantes, notamment les vaccins. Les vaccins restent essentiels pour réduire la maladie grave et la mortalité, y compris contre la variante circulante dominante, Delta. Les vaccins actuels restent efficaces contre les maladies graves et les décès.
Efficacité des tests actuels : Les tests PCR largement utilisés continuent de détecter l’infection, y compris l’infection par Omicron, comme nous l’avons également constaté avec d’autres variantes. Des études sont en cours pour déterminer s’il y a un impact sur d’autres types de tests, notamment les tests de détection rapide d’antigènes.
Efficacité des traitements actuels : Les corticostéroïdes et les bloqueurs de récepteurs IL6 seront toujours efficaces pour gérer les patients atteints de COVID-19 sévère. D’autres traitements seront évalués pour voir s’ils sont toujours aussi efficaces compte tenu des modifications apportées à certaines parties du virus dans la variante Omicron.
Études en cours
A l’heure actuelle, l’OMS coordonne avec un grand nombre de chercheurs dans le monde entier pour mieux comprendre Omicron. Les études en cours ou à venir comprennent des évaluations de la transmissibilité, de la gravité de l’infection (y compris les symptômes), de la performance des vaccins et des tests de diagnostic, et de l’efficacité des traitements.
Mesures recommandées pour les personnes
Les mesures les plus efficaces que les personnes peuvent prendre pour réduire la propagation du virus COVID-19 sont les suivantes : garder une distance physique d’au moins 1 mètre avec les autres ; porter un masque bien ajusté ; ouvrir les fenêtres pour améliorer la ventilation ; éviter les espaces mal ventilés ou encombrés ; garder les mains propres ; tousser ou éternuer dans un coude ou un mouchoir en papier ; et se faire vacciner quand c’est son tour.
L’OMS continuera à fournir des mises à jour au fur et à mesure que des informations supplémentaires seront disponibles, notamment après les réunions du TAG-VE. En outre, des informations seront disponibles sur les plateformes numériques et les médias sociaux de l’OMS.
mettre à jour :
Il y a 6 heures, l’organisation mondiale de la santé a donné un nom officiel à B.1.1.529 sous le nom d’Omicron.
Sur la base des preuves présentées indiquant un changement préjudiciable dans l’épidémiologie de COVID-19, le TAG-VE a conseillé à l’OMS de désigner cette variante comme un COV, et l’OMS a désigné B.1.1.529 comme un COV, nommé Omicron.
Les pays sont donc invités à prendre les mesures suivantes :
- renforcer les efforts de surveillance et de séquençage afin de mieux comprendre les variantes circulantes du SRAS-CoV-2.
- soumettre les séquences génomiques complètes et les métadonnées associées à une base de données accessible au public, telle que GISAID.
- signaler les premiers cas/clusters associés à l’infection par le COV à l’OMS par le biais du mécanisme RSI.
- lorsque les capacités existent et en coordination avec la communauté internationale, effectuer des enquêtes sur le terrain et des évaluations en laboratoire pour améliorer la compréhension des impacts potentiels du COVID-19 sur l’épidémiologie, la gravité, l’efficacité des mesures de santé publique et sociales, les méthodes de diagnostic, les réponses immunitaires, la neutralisation des anticorps ou d’autres caractéristiques pertinentes.
Il est rappelé aux personnes de prendre des mesures pour réduire leur risque de contracter le COVID-19, y compris des mesures de santé publique et sociales éprouvées telles que le port de masques bien ajustés, l’hygiène des mains, la distanciation physique, l’amélioration de la ventilation des espaces intérieurs, l’évitement des espaces bondés et la vaccination.
Classification d’Omicron (B.1.1.529) : Variant préoccupant du SRAS-CoV-2
Les chercheurs d’Afrique du Sud s’efforcent de suivre la progression inquiétante d’une nouvelle variante du coronavirus responsable du COVID-19. Ce variant comporte un grand nombre de mutations que l’on retrouve dans d’autres variants, dont le Delta, et il semble se propager rapidement en Afrique du Sud.
La priorité absolue est de suivre de plus près la variante à mesure qu’elle se propage : elle a été identifiée pour la première fois au Botswana ce mois-ci et a été détectée chez des voyageurs se rendant à Hong Kong depuis l’Afrique du Sud. Les scientifiques tentent également de comprendre les propriétés de la variante, notamment si elle peut échapper aux réponses immunitaires déclenchées par les vaccins et si elle provoque une maladie plus ou moins grave que les autres variantes.
« Nous avançons à la vitesse de la lumière », déclare Penny Moore, virologue à l’université de Witwatersrand à Johannesburg, dont le laboratoire évalue le potentiel de la variante à contourner l’immunité des vaccins et des infections précédentes. Il existe des rapports anecdotiques de réinfections et de cas chez des personnes vaccinées, mais « à ce stade, il est trop tôt pour se prononcer », ajoute Mme Moore.
« Il y a beaucoup de choses que nous ne comprenons pas au sujet de cette variante », a déclaré Richard Lessells, médecin spécialiste des maladies infectieuses à l’Université de KwaZulu-Natal à Durban, en Afrique du Sud, lors d’un point de presse organisé par le ministère sud-africain de la santé le 25 novembre. « Le profil de mutation nous inquiète, mais nous devons maintenant faire le travail nécessaire pour comprendre la signification de cette variante et ce qu’elle signifie pour la réponse à la pandémie. »
Un groupe d’experts de l’Organisation mondiale de la santé (OMS) se réunira le 26 novembre et qualifiera probablement la souche – actuellement connue sous le nom de B.1.1.529 – de variante préoccupante ou de variante intéressante, a déclaré Tulio de Oliveira, bioinformaticien à l’Université de KwaZulu-Natal, lors de la réunion d’information. La variante sera probablement nommée Nu – la prochaine lettre disponible dans le système de dénomination grec des variantes de coronavirus – si elle est signalée par le groupe de l’OMS.
Les chercheurs veulent également mesurer le potentiel de propagation de la variante à l’échelle mondiale, ce qui pourrait déclencher de nouvelles vagues d’infection ou exacerber les hausses actuelles provoquées par le Delta.
Modifications de l’épi
Les chercheurs ont repéré la variante B.1.1.529 dans les données de séquençage du génome provenant du Botswana. Le variant s’est distingué parce qu’il contient plus de 30 modifications de la protéine spike – la protéine du SRAS-CoV-2 qui reconnaît les cellules hôtes et constitue la principale cible des réponses immunitaires de l’organisme. Bon nombre de ces modifications ont été trouvées dans des variantes telles que Delta et Alpha et sont liées à une infectivité accrue et à la capacité d’échapper aux anticorps bloquant l’infection.
Mais la forte augmentation apparente de la variante dans la province sud-africaine de Gauteng – où se trouve Johannesburg – tire également la sonnette d’alarme. Les cas ont augmenté rapidement dans la province en novembre, en particulier dans les écoles et chez les jeunes, selon Lessells. Le séquençage du génome et d’autres analyses génétiques effectuées par l’équipe de M. de Oliveria ont révélé que la variante B.1.1.529 était responsable de la totalité des 77 échantillons du virus qu’ils ont analysés à Gauteng, collectés entre le 12 et le 20 novembre. L’analyse de centaines d’autres échantillons est en cours.
Cette variante est porteuse d’une mutation en pointe qui permet de la détecter par des tests de génotypage qui fournissent des résultats beaucoup plus rapidement que le séquençage du génome, a expliqué M. Lessells. Les résultats préliminaires de ces tests suggèrent que la variante B.1.1.529 se propage bien au-delà de Gauteng. « Cela nous fait craindre que cette variante puisse déjà circuler assez largement dans le pays », a déclaré M. Lessells.
Efficacité des vaccins
Pour comprendre la menace que représente B.1.1.529, les chercheurs vont suivre de près sa propagation en Afrique du Sud et au-delà. Les chercheurs d’Afrique du Sud se sont mobilisés pour étudier rapidement la variante Beta, identifiée dans ce pays fin 2020, et un effort similaire commence à étudier la B.1.1.529.
L’équipe de Moore – qui a fourni certaines des premières données sur la capacité de Beta à esquiver l’immunité – a commencé à travailler sur B.1.1.529. Elle prévoit de tester la capacité du virus à échapper aux anticorps bloquant l’infection, ainsi qu’à d’autres réponses immunitaires. La variante comporte un nombre élevé de mutations dans les régions de la protéine spike que les anticorps reconnaissent, ce qui peut atténuer leur efficacité. « De nombreuses mutations que nous connaissons sont problématiques, mais beaucoup d’autres semblent contribuer à une plus grande évasion », explique M. Moore. La modélisation informatique donne même à penser que la souche B.1.1.529 pourrait échapper à l’immunité conférée par un autre composant du système immunitaire, les cellules T, ajoute Mme Moore. Son équipe espère obtenir ses premiers résultats dans deux semaines.
« Une question brûlante est de savoir si cela réduit l’efficacité des vaccins, car il y a tellement de changements », déclare Aris Katzourakis, qui étudie l’évolution des virus à l’Université d’Oxford, au Royaume-Uni.
Les chercheurs d’Afrique du Sud étudieront également si la variante B.1.1.529 provoque une maladie plus grave ou plus bénigne que les autres variantes, a précisé M. Lessells. « La question vraiment clé se pose autour de la sévérité de la maladie ».
Jusqu’à présent, la menace que représente B.1.1.529 au-delà de l’Afrique du Sud est loin d’être claire, selon les chercheurs. Il n’est pas clair si la variante est plus transmissible que Delta, dit Moore, parce qu’il y a actuellement un faible nombre de cas de COVID-19 en Afrique du Sud. « Nous sommes dans une période d’accalmie », dit-elle. Selon M. Katzourakis, les pays où Delta est très répandu devraient être attentifs aux signes de la variante B.1.1.529. « Nous devons voir ce que ce virus fait en termes de succès concurrentiel et s’il va augmenter en prévalence. »
étude de référence :
doi: https://doi.org/10.1038/d41586-021-03552-w