Attention ! (B.1.1.529 Omicron) Une variante fortement mutée du coronavirus met les scientifiques en alerte !

Des médecins dans une unité de traitement des maladies infectieuses en Afrique du Sud, où une nouvelle souche de COVID se propage rapidement.

Mise à jour de l’OMS sur Omicron – 28 novembre 2021

Le 26 novembre 2021, l’OMS a désigné la variante B.1.1.529 comme une variante préoccupante, appelée Omicron, sur les conseils du Groupe consultatif technique sur l’évolution des virus (TAG-VE) de l’OMS. Cette décision s’appuie sur les preuves présentées au TAG-VE selon lesquelles Omicron présente plusieurs mutations qui peuvent avoir un impact sur son comportement, par exemple sur sa facilité de propagation ou la gravité de la maladie qu’il provoque. Voici un résumé de ce que l’on sait actuellement.

Connaissances actuelles sur Omicron

Des chercheurs d’Afrique du Sud et du monde entier mènent des études pour mieux comprendre de nombreux aspects d’Omicron. Nous continuerons à partager les résultats de ces études dès qu’ils seront disponibles.

Transmissibilité : On ne sait pas encore si Omicron est plus transmissible (c’est-à-dire plus facilement transmissible d’une personne à l’autre) que d’autres variantes, notamment Delta. Le nombre de personnes testées positives a augmenté dans les régions d’Afrique du Sud touchées par cette variante, mais des études épidémiologiques sont en cours pour comprendre si cela est dû à Omicron ou à d’autres facteurs.

Gravité de la maladie : On ne sait pas encore si l’infection par Omicron entraîne une maladie plus grave que les infections par d’autres variantes, notamment Delta. Les données préliminaires suggèrent une augmentation des taux d’hospitalisation en Afrique du Sud, mais cela pourrait être dû à l’augmentation du nombre total de personnes infectées, plutôt qu’à une infection spécifique par Omicron. Aucune information ne permet actuellement de penser que les symptômes associés à Omicron sont différents de ceux des autres variantes. Les premières infections signalées concernaient des étudiants universitaires – des personnes plus jeunes qui ont tendance à présenter une maladie plus bénigne – mais il faudra plusieurs jours à plusieurs semaines pour comprendre le niveau de gravité de la variante Omicron. Toutes les variantes de COVID-19, y compris la variante Delta qui est dominante dans le monde, peuvent provoquer une maladie grave ou la mort, en particulier chez les personnes les plus vulnérables, et la prévention est donc toujours essentielle.

Efficacité d’une infection antérieure par le SRAS-CoV-2

Les données préliminaires suggèrent qu’il pourrait y avoir un risque accru de réinfection avec l’Omicron (c’est-à-dire que les personnes ayant déjà eu le COVID-19 pourraient être réinfectées plus facilement avec l’Omicron), par rapport aux autres variantes préoccupantes, mais les informations sont limitées. De plus amples informations à ce sujet seront disponibles dans les jours et semaines à venir.

Efficacité des vaccins : L’OMS travaille avec des partenaires techniques pour comprendre l’impact potentiel de ce variant sur nos contre-mesures existantes, notamment les vaccins. Les vaccins restent essentiels pour réduire la maladie grave et la mortalité, y compris contre la variante circulante dominante, Delta. Les vaccins actuels restent efficaces contre les maladies graves et les décès.

Efficacité des tests actuels : Les tests PCR largement utilisés continuent de détecter l’infection, y compris l’infection par Omicron, comme nous l’avons également constaté avec d’autres variantes. Des études sont en cours pour déterminer s’il y a un impact sur d’autres types de tests, notamment les tests de détection rapide d’antigènes.

Efficacité des traitements actuels : Les corticostéroïdes et les bloqueurs de récepteurs IL6 seront toujours efficaces pour gérer les patients atteints de COVID-19 sévère. D’autres traitements seront évalués pour voir s’ils sont toujours aussi efficaces compte tenu des modifications apportées à certaines parties du virus dans la variante Omicron.

Études en cours

A l’heure actuelle, l’OMS coordonne avec un grand nombre de chercheurs dans le monde entier pour mieux comprendre Omicron. Les études en cours ou à venir comprennent des évaluations de la transmissibilité, de la gravité de l’infection (y compris les symptômes), de la performance des vaccins et des tests de diagnostic, et de l’efficacité des traitements.

Mesures recommandées pour les personnes

Les mesures les plus efficaces que les personnes peuvent prendre pour réduire la propagation du virus COVID-19 sont les suivantes : garder une distance physique d’au moins 1 mètre avec les autres ; porter un masque bien ajusté ; ouvrir les fenêtres pour améliorer la ventilation ; éviter les espaces mal ventilés ou encombrés ; garder les mains propres ; tousser ou éternuer dans un coude ou un mouchoir en papier ; et se faire vacciner quand c’est son tour.

L’OMS continuera à fournir des mises à jour au fur et à mesure que des informations supplémentaires seront disponibles, notamment après les réunions du TAG-VE. En outre, des informations seront disponibles sur les plateformes numériques et les médias sociaux de l’OMS.


mettre à jour :

Il y a 6 heures, l’organisation mondiale de la santé a donné un nom officiel à B.1.1.529 sous le nom d’Omicron.

Sur la base des preuves présentées indiquant un changement préjudiciable dans l’épidémiologie de COVID-19, le TAG-VE a conseillé à l’OMS de désigner cette variante comme un COV, et l’OMS a désigné B.1.1.529 comme un COV, nommé Omicron.

Les pays sont donc invités à prendre les mesures suivantes :

  • renforcer les efforts de surveillance et de séquençage afin de mieux comprendre les variantes circulantes du SRAS-CoV-2.
  • soumettre les séquences génomiques complètes et les métadonnées associées à une base de données accessible au public, telle que GISAID.
  • signaler les premiers cas/clusters associés à l’infection par le COV à l’OMS par le biais du mécanisme RSI.
  • lorsque les capacités existent et en coordination avec la communauté internationale, effectuer des enquêtes sur le terrain et des évaluations en laboratoire pour améliorer la compréhension des impacts potentiels du COVID-19 sur l’épidémiologie, la gravité, l’efficacité des mesures de santé publique et sociales, les méthodes de diagnostic, les réponses immunitaires, la neutralisation des anticorps ou d’autres caractéristiques pertinentes.

Il est rappelé aux personnes de prendre des mesures pour réduire leur risque de contracter le COVID-19, y compris des mesures de santé publique et sociales éprouvées telles que le port de masques bien ajustés, l’hygiène des mains, la distanciation physique, l’amélioration de la ventilation des espaces intérieurs, l’évitement des espaces bondés et la vaccination.

Classification d’Omicron (B.1.1.529) : Variant préoccupant du SRAS-CoV-2


Les chercheurs d’Afrique du Sud s’efforcent de suivre la progression inquiétante d’une nouvelle variante du coronavirus responsable du COVID-19. Ce variant comporte un grand nombre de mutations que l’on retrouve dans d’autres variants, dont le Delta, et il semble se propager rapidement en Afrique du Sud.

La priorité absolue est de suivre de plus près la variante à mesure qu’elle se propage : elle a été identifiée pour la première fois au Botswana ce mois-ci et a été détectée chez des voyageurs se rendant à Hong Kong depuis l’Afrique du Sud. Les scientifiques tentent également de comprendre les propriétés de la variante, notamment si elle peut échapper aux réponses immunitaires déclenchées par les vaccins et si elle provoque une maladie plus ou moins grave que les autres variantes.

« Nous avançons à la vitesse de la lumière », déclare Penny Moore, virologue à l’université de Witwatersrand à Johannesburg, dont le laboratoire évalue le potentiel de la variante à contourner l’immunité des vaccins et des infections précédentes. Il existe des rapports anecdotiques de réinfections et de cas chez des personnes vaccinées, mais « à ce stade, il est trop tôt pour se prononcer », ajoute Mme Moore.

« Il y a beaucoup de choses que nous ne comprenons pas au sujet de cette variante », a déclaré Richard Lessells, médecin spécialiste des maladies infectieuses à l’Université de KwaZulu-Natal à Durban, en Afrique du Sud, lors d’un point de presse organisé par le ministère sud-africain de la santé le 25 novembre. « Le profil de mutation nous inquiète, mais nous devons maintenant faire le travail nécessaire pour comprendre la signification de cette variante et ce qu’elle signifie pour la réponse à la pandémie. »

Un groupe d’experts de l’Organisation mondiale de la santé (OMS) se réunira le 26 novembre et qualifiera probablement la souche – actuellement connue sous le nom de B.1.1.529 – de variante préoccupante ou de variante intéressante, a déclaré Tulio de Oliveira, bioinformaticien à l’Université de KwaZulu-Natal, lors de la réunion d’information. La variante sera probablement nommée Nu – la prochaine lettre disponible dans le système de dénomination grec des variantes de coronavirus – si elle est signalée par le groupe de l’OMS.

Les chercheurs veulent également mesurer le potentiel de propagation de la variante à l’échelle mondiale, ce qui pourrait déclencher de nouvelles vagues d’infection ou exacerber les hausses actuelles provoquées par le Delta.

Modifications de l’épi

Les chercheurs ont repéré la variante B.1.1.529 dans les données de séquençage du génome provenant du Botswana. Le variant s’est distingué parce qu’il contient plus de 30 modifications de la protéine spike – la protéine du SRAS-CoV-2 qui reconnaît les cellules hôtes et constitue la principale cible des réponses immunitaires de l’organisme. Bon nombre de ces modifications ont été trouvées dans des variantes telles que Delta et Alpha et sont liées à une infectivité accrue et à la capacité d’échapper aux anticorps bloquant l’infection.

Mais la forte augmentation apparente de la variante dans la province sud-africaine de Gauteng – où se trouve Johannesburg – tire également la sonnette d’alarme. Les cas ont augmenté rapidement dans la province en novembre, en particulier dans les écoles et chez les jeunes, selon Lessells. Le séquençage du génome et d’autres analyses génétiques effectuées par l’équipe de M. de Oliveria ont révélé que la variante B.1.1.529 était responsable de la totalité des 77 échantillons du virus qu’ils ont analysés à Gauteng, collectés entre le 12 et le 20 novembre. L’analyse de centaines d’autres échantillons est en cours.

Cette variante est porteuse d’une mutation en pointe qui permet de la détecter par des tests de génotypage qui fournissent des résultats beaucoup plus rapidement que le séquençage du génome, a expliqué M. Lessells. Les résultats préliminaires de ces tests suggèrent que la variante B.1.1.529 se propage bien au-delà de Gauteng. « Cela nous fait craindre que cette variante puisse déjà circuler assez largement dans le pays », a déclaré M. Lessells.

Efficacité des vaccins

Pour comprendre la menace que représente B.1.1.529, les chercheurs vont suivre de près sa propagation en Afrique du Sud et au-delà. Les chercheurs d’Afrique du Sud se sont mobilisés pour étudier rapidement la variante Beta, identifiée dans ce pays fin 2020, et un effort similaire commence à étudier la B.1.1.529.

L’équipe de Moore – qui a fourni certaines des premières données sur la capacité de Beta à esquiver l’immunité – a commencé à travailler sur B.1.1.529. Elle prévoit de tester la capacité du virus à échapper aux anticorps bloquant l’infection, ainsi qu’à d’autres réponses immunitaires. La variante comporte un nombre élevé de mutations dans les régions de la protéine spike que les anticorps reconnaissent, ce qui peut atténuer leur efficacité. « De nombreuses mutations que nous connaissons sont problématiques, mais beaucoup d’autres semblent contribuer à une plus grande évasion », explique M. Moore. La modélisation informatique donne même à penser que la souche B.1.1.529 pourrait échapper à l’immunité conférée par un autre composant du système immunitaire, les cellules T, ajoute Mme Moore. Son équipe espère obtenir ses premiers résultats dans deux semaines.

« Une question brûlante est de savoir si cela réduit l’efficacité des vaccins, car il y a tellement de changements », déclare Aris Katzourakis, qui étudie l’évolution des virus à l’Université d’Oxford, au Royaume-Uni.

Les chercheurs d’Afrique du Sud étudieront également si la variante B.1.1.529 provoque une maladie plus grave ou plus bénigne que les autres variantes, a précisé M. Lessells. « La question vraiment clé se pose autour de la sévérité de la maladie ».

Jusqu’à présent, la menace que représente B.1.1.529 au-delà de l’Afrique du Sud est loin d’être claire, selon les chercheurs. Il n’est pas clair si la variante est plus transmissible que Delta, dit Moore, parce qu’il y a actuellement un faible nombre de cas de COVID-19 en Afrique du Sud. « Nous sommes dans une période d’accalmie », dit-elle. Selon M. Katzourakis, les pays où Delta est très répandu devraient être attentifs aux signes de la variante B.1.1.529. « Nous devons voir ce que ce virus fait en termes de succès concurrentiel et s’il va augmenter en prévalence. »

étude de référence :
doi: https://doi.org/10.1038/d41586-021-03552-w

Retour haut de page